Belirli genlerin veya gen gruplarının analizine odaklanan NGS panelleridir. Bu paneller, genellikle kalıtsal hastalıkların tanısı, kanser genetiği ve diğer genetik bozuklukların araştırılması amacıyla kullanılır. Hedefli paneller, belirli genetik varyasyonları tespit etmek için tasarlanmış olup, geniş bir genom dizileme yöntemine göre daha hızlı ve maliyet etkin bir çözüm sunar.