Bağışıklık sistemini etkileyen bir başka genetik belirteçtir. Özellikle ilaç reaksiyonları ve belirli enfeksiyonlarla bağlantısı üzerinde durulmaktadır. Abakavir Alerjisi, otoimmun hastalıklar, kronik viral enfeksiyonların tedavisine yön verir.