NGS (Next- Generation Sequencing) tabanlı HLA tiplendirme, hassas ve yüksek çözünürlüklü analizi için kullanılan bir yöntemdir. Yöntem; DNA analizi, HLA gen amplifikasyonu, kütüphane hazırlığı, NGS platformunda dizileme ve biyoinformatik analiz seklinde bir akış şeması bulunmaktadır.

Avantajları; HLA genlerinin tüm ekzonları, intronları dizilenebilir. Genlerdeki polimorfizimler ve nadir varyantlar tespit edilebilir.