Metagenomik sekanslama, bir ortamda bulunan mikroorganizmaların (bakteriler, arkealar, virüsler, mantarlar vb.) toplu genetik materyalini analiz etmek için kullanılan bir tekniktir. Bu yöntem, birçok mikroorganizmanın genetik bilgisini bir arada elde etmeyi sağlar ve bu sayede, kültürlenmeden bağımsız olarak mikroorganizmaların çeşitliliği, yapısı ve işlevi hakkında bilgi edinilir.
